基于超算的药物智能设计
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Abstract
目前的药物分子主要以蛋白质作为靶标,因此研究蛋白质结构和化合物分子是药物设计的关键。针对这两类分子,研究组长期结合高性能计算和AI方法,在蛋白质和小分子的表示学习、以及它们之间的相互作用开展了广泛的研究。报告将介绍我们最新通过图卷积算法的研发,在蛋白质功能及药物设计领域取得了一系列进展,开发了整套的药物设计算法,包括药物虚拟筛选、设计及优化、ADMET性质预测,同时结合知识图谱在多组学水平开展药物发现。基于这些算法软件,我们在“天河二号”构建药物设计和多组学分析的一站式高性能计算服务。
Bio
杨跃东,中山大学计算机学院教授、国家超算广州中心副总工程师,入选国家级人才,是科技部创新团队及广东省创新团队核心成员,主持国家重点研发课题、基金委面上项目及新冠专项、和广东省重点研发项目等。担任Nature子刊Communication Biology和BMC Bioinformatics杂志编委;是中国计算机学会生物信息计算专委、广东省高性能计算学会监委、广东省精准医学会人工智能和大数据专委副主任。在Nature Machine Intelligence、Bioinformatics等领域顶级杂志和人工智能顶会(IJCAI、AAAI等)上已发表100多篇论文,引用超6000次,H-index=39。目前主要研究最新高性能计算及人工智能算法,研发多组学大数据挖掘及药物智能设计算法,并结合“天河二号”开发统一的生物医药高性能计算平台,提供“一站式”生物医药应用计算服务。